回族形成于公元13世纪，距今已有近七百多年的历史，据口碑资料，回民迁居郫县约在清顺治十七年（公元1660年）至康熙二十一年（公元1682年）从湖北麻城县孝感乡信及陕西省渭南，凤翔、三源等地迁入。其中马、丁、谭、郭、郝诸姓人，先在县城北郊鱼塘坎居住耕种，后又有部分移居万寿场（唐元）丁、郝、马、哈等姓人修建了清真寺，由于外来回民日渐增多，清真寺也逐渐在回民较为集中的乡镇修建起来。
最早的是鱼塘坎清真寺（崇兴）其后有万寿场清真寺，八里桥清真寺（红光），雷打桥清真寺（永兴），团结两坊清真寺（张家寺、马家寺）。后在公元1835年陕西回民起义失败，从陕西凤翔小菜园迁来大批黎姓回民落足万寿场（唐元）并集资又建了一坊清真寺，加上原有的一坊，故称上、下礼拜寺，故在解放前郫县境内共有清真寺七坊。
早来郫县的回民，大多数务农，后有少数回民弃农经商进入县城城关及乡镇，因城关回民增多，在清乾隆初年（公元1736年），经回民群众商议便把鱼塘坎清真寺，拆迁至郫筒镇西外街,重新扩大修建，即今郫筒清真寺的前期经历。那时郫县的回民，已有丁、马、海、保、杨、张、罗、琐等姓，人口众多。俗称上起“子云亭”下止“八里桥”。而“保家巷”的得名，是由十二户保姓回民，在此买地建房，聚居而成巷。每年的开斋节、古尔邦节清真寺内大殿上下都跪满了礼拜的回民，每当回民会聚时都要互道“色兰”。由于郫县回民人丁增多，外地来郫经商的回民马图就在“古羊巷”开办了羊行，从事贩羊生意。在今农机训练班所在地（宝生街），解放前叫“牛市坝”，是马姓回民的屠牛场和喂牛场。丁姓回民几弟兄也以屠牛为业，兼制牛草和熬牛皮胶。在郫筒清真寺左侧，有回民马润斋开的“清真阁”茶园，右侧有回民马东甫开的“民全客店”，在郫筒一小附近有回民罗良武开的“教门法义长”面食店，在郫县还有一定名气。
由于郫县商业发达，松潘回民也来了不少，他们自愿集资，由回民马华成负责，在八里桥（红光）修建了八里桥清真寺。
此时的郫筒清真寺已有一定的寺产，临街的街房铺面及周围的住房、面积近七市亩，公墓三亩有零。在旧社会，由于连年战乱，统治阶级大民族主义造成的民族歧视的不良影响，郫县城关回民，有的当兵外出；有的举家外迁，另谋生路，因此回民人口逐年减少。
郫筒清真寺历任住寺阿訇有：松潘人：马阿訇、蒙阿訇；成都人：马润斋阿訇，清阳孝泉人金国明阿訇，川北人。任义庭阿訇，马俊卿是最后一任阿訇。
十年浩劫中，郫筒清真寺遭到了极大的破坏。在党的十一届三中全会后，党的民族宗教政策得到了全面落实，经由回民代表、县政协委员、八十八岁高龄的丁庆明老先生召集回民群众共同商量后，成立了“恢复郫筒清真寺筹备组”，丁老自担组长之职，成员有马锡淑、马立全、马光德、丁德元。由马光德负责与各地各级有关部门和人员联系，办理一切来往事务和进行一些必要的活动，功夫不负苦心人，各地陆续送来也贴（捐资）两万多元。经过大家一起精打细算，全面修复了郫筒清真寺。县人民政府随即批准开放。在1991年10月20日举行开放暨圣纪纪念大会。19日夜，寺内灯火辉煌，人声鼎沸，来自各地的三百多名穆斯林头戴小白帽，聚集在寺内虔诚地聆听由成都市伊斯兰教协会副会长张世明阿訇宣讲“瓦尔兹”并“赞圣”等宗教仪式。寺大门上悬挂着由时任县委副书记的王传义题写的“清真寺”三个汉字，上方由省伊协副会长、西昌的杨华阿訇书写的阿文“买土志德”（清真寺）。全寺内外，张灯结彩，彩旗飘扬，各种鲜花竞相斗艳，客堂门前挂着市伊协赠送的横幅“爱国爱教”。大殿正门上挂着市伊协会长马立本阿訇书写的阿文匾额，大殿前四株亭亭玉立的大楠木树，浓荫覆盖。修复后的古寺，越发显得雄伟壮观。
当天约五六百人，欢聚一堂，互道“色兰”。这是郫筒清真寺有史以来举行宗教仪式最为隆重的一次。上午十时，由成都市伊协副会长张世明阿訇讲“互尔兹”：“爱国爱教，民族自尊，穆斯林群众应在党的领导下，拥护改革开放，遵纪守法，宏扬民族精神，克服自满情绪，为四化贡献力量，在此基础上，把清真寺办好、管好”。
各地清真寺管委会派员前来祝贺。到会的有：省宗教局局长王善敦、市民委主任马维因、市伊协秘书长马云竹、市伊协秘书长马嘉谋、市宗教局一处杨处长、县人民政府黄副县长、郫筒镇党委副书记森林、县委统战部部长付家烈、副部长王德阳、公安局何科长，城关派出所杨所长，宗教科科长翁少良等。
有关领导同志讲了话，并热烈地致了祝贺词，还殷切地提出了今后的希望。省、市电视台弓箭同志，省军区录像中心的丁主任进行了实况录像。四天后，在省电视台的二、十两个频道播放约二分钟。
圣纪会餐后，外地穆斯林互道“色兰”依依惜别，各级领导一一握手告别，乘车离去。看到今天“圣纪”纪念大会的盛况，广大穆斯林按捺不住内心激情，齐声高呼：
主啊，“者玛尔提”（清真寺）恢复了。
没有共产党就没有一切。感谢党和政府对我们穆斯林的关心和支持。